專業(yè)名詞背后有故事 生命科學(xué)十大進展其實不難懂
1月10日，中國科協(xié)評選出2019年度“中國生命科學(xué)十大進展”，發(fā)表于頂級期刊并產(chǎn)生廣泛影響的科學(xué)發(fā)現(xiàn)入選。一如既往地，讀著諸如“破解硅藻光合膜蛋白超分子結(jié)構(gòu)”“單堿基基因編輯造成大量脫靶效應(yīng)及其優(yōu)化解決方法”等滿是專業(yè)名稱的專業(yè)用詞，很多人表示“很難懂”。但它們經(jīng)過專家講解，中小學(xué)生們也能聽得津津有味。
“在去年舉辦的進展交流會暨青少年科普報告會上，很多孩子提出的問題說明動了腦筋，也消化了這些理論，很有思想，讓科學(xué)家們都很驚詫。”中國科協(xié)生命科學(xué)學(xué)會聯(lián)合體秘書長王小寧表示，實際上，這些成果不僅是學(xué)術(shù)上的重大進展，也為我們揭示了很多生命科學(xué)的奧秘，理解它們并不難。
為了便于理解，科技日報記者梳理了其中有特色的幾個，講述其蘊含的生命故事，打破生命科學(xué)重大進展難理解的形象。
最陽光通透：硅藻“吃光機”結(jié)構(gòu)被看清
除了陸生植物，水下的藻類也能進行光合作用，“吃掉”陽光，轉(zhuǎn)變出有機物和氧氣。其中最“成功”的浮游光合生物當(dāng)屬海洋中的硅藻了。
當(dāng)選十大的“破解硅藻光合膜蛋白超分子結(jié)構(gòu)和功能之謎”正是解答了什么精巧的結(jié)構(gòu)，讓硅藻能夠“埋頭”在水里還能進行光合作用。
中國科學(xué)院植物研究所沈建仁、匡廷云研究團隊在國際上首次解析了硅藻捕光天線膜蛋白，這“團”蛋白不僅能高效捕獲藍綠光、高效傳遞和轉(zhuǎn)化光能，還能夠起到光保護的作用。
首先要說明這是一“團”蛋白，就好像工廠機器，是有組合和流水線的。因此很多人形象地稱生物體里承擔(dān)某一生命互動功能地蛋白為“蛋白工廠”，而學(xué)術(shù)上稱為“蛋白復(fù)合體”，因為復(fù)合體的組成很像樂高拼插，只不過零件是單個蛋白。
此次解析是超高精度的解析，類似于用一個幾百萬倍的放大鏡把硅藻上的“吃光機”零部件一個齒輪一個齒輪地看清楚。
“把蛋白質(zhì)復(fù)合物提出來以后，我們用冷凍電鏡了解它的結(jié)構(gòu)，它的結(jié)構(gòu)非常復(fù)雜，包括70個蛋白質(zhì)。”沈建仁說。這70個蛋白質(zhì)“零件”卻與樂高零件完全不同，它不是規(guī)則的，而是枝枝杈杈的，電子云團互相作用，互相協(xié)同，完成了吸收光能把水分解成氧氣、轉(zhuǎn)移電子、釋放能量等一系列任務(wù)。
但要看清原子、電子之間的作用，冷凍電鏡只能看到個模糊的輪廓，就好像從千米高空俯視群島輪廓，要看到有哪些港口、怎么吞吐運送“貨物”（電子）還需要更高的精度。團隊隨后用蛋白結(jié)晶衍射法將蛋白質(zhì)復(fù)合物的結(jié)構(gòu)精度做到了1.8埃（10-10米）的高分辨率，原子直徑的數(shù)量級大約是1埃，在這個精度上每個原子清晰可見。
為什么要對一個硅藻細(xì)胞膜上的蛋白質(zhì)“團”大費周章呢？中國科學(xué)院院士匡廷云給出答案：“光合作用是地球上最大規(guī)模的利用光能、化學(xué)能把二氧化碳和水變成有機物儲存在體內(nèi)的生命活動。海洋生態(tài)系統(tǒng)的低等植物每年通過光合作用合成的干物質(zhì)是2200億噸，人類每年的耗能僅僅占這一總量的1/10。硅藻的光合作用貢獻了地球上每年約20%的原初生產(chǎn)力。它們之所以能起這么大的作用，主要跟硅藻光合膜蛋白的結(jié)構(gòu)與功能密切相關(guān)。”
據(jù)介紹，解析的巖藻黃素已經(jīng)用在減肥藥品中，并在推進臨床試驗。未來，這些看似遙遠的蛋白，究竟能在顯示生活中起到哪些作用，在人類體內(nèi)又有哪些功效，期待更多的研究和驗證。
最親近自然：那頭麋鹿有一雙抗癌的角
提到鹿，人們總會想起它亭亭玉立，豎耳靜聽，一雙通靈般的眼睛警覺地望向前方，鹿角蜿蜒挺立頭頂。
這幅靜美的圖畫里，其實是旺盛而獨特的生命活動——
“鹿科動物有一個特征，它是癌癥發(fā)生率最低的動物，但它角上的細(xì)胞卻具有比癌細(xì)胞還旺盛的繁殖能力，是唯一能夠完全再生的哺乳動物器官。”西北工業(yè)大學(xué)教授王文說，這個奇特現(xiàn)象背后的奧秘將和人類的健康息息相關(guān)。
“我們進行的研究通過大尺度跨反芻動物的全部6個科、覆蓋大部分屬種的組學(xué)大數(shù)據(jù)分析，結(jié)合功能驗證，揭示了其中的奧秘。”王文說，“結(jié)果對于我們理解反芻動物的演化歷史，再生醫(yī)學(xué)、腫瘤生物學(xué)、睡眠紊亂和骨質(zhì)疏松癥等醫(yī)學(xué)研究，以及培育新品種家畜都有重要意義。”
“鹿角每天可以長1—2厘米，幾個月時間就可長成一個10公斤的大家伙，比任何腫瘤長得都快。”王文說，通過組學(xué)的研究，他們發(fā)現(xiàn)鹿角細(xì)胞激活了大量的癌癥基因，從而促進了自身的生長。
癌癥基因被激活了，卻僅僅被“截留”在鹿角部位，不會擴散也不會引起其他癌癥癥狀，這又是為什么呢？通過組學(xué)大數(shù)據(jù)的分析，研究第一次把鹿科動物低癌的現(xiàn)象和很強的再生能力聯(lián)系起來。大量的抑癌基因，如p53通路的基因受到了強烈的自然選擇，可能與鹿科動物癌癥發(fā)生率很低有關(guān)。這表明，鹿角再生能力和鹿的抗癌能力源于同一通路調(diào)控，了解這一機制，將會為再生醫(yī)學(xué)和癌癥研究帶來新的思路。
圣誕老人的座駕馴鹿，生活在北極，那里晝夜不規(guī)律也沒有陽光。“這和當(dāng)代一些‘年輕宅’們的生活環(huán)境有著很高的相似度，可它們?yōu)槭裁礇]有精神壓力方面的問題，也沒有維生素D缺乏引起的骨發(fā)育問題呢？”王文說，大尺度組學(xué)對比研究發(fā)現(xiàn)，馴鹿與晝夜節(jié)律相關(guān)的基因發(fā)生了突變，控制維生素D代謝的基因在自然選擇作用下，兩個關(guān)鍵酶活性遠高于其它動物，因此保障了其在低光照條件下依然能夠高效進行鈣代謝，促進鹿角的生長。
最具攻擊力：擊破結(jié)核桿菌致密胞壁
一種曾經(jīng)上市銷售的減肥藥被發(fā)現(xiàn)是結(jié)核桿菌的“毒藥”——
“利莫那班（該減肥藥名稱）原來是針對人源大麻素受體CB1的拮抗劑，起到減肥作用，很難想象靶向人類蛋白受體的藥物也可以殺死結(jié)核桿菌。”上海科技大學(xué)免疫化學(xué)研究所副研究員張兵說。
那么結(jié)核桿菌上什么樣的“命門”被抓住了呢？膜蛋白“MmpL3”負(fù)責(zé)把細(xì)菌在細(xì)胞內(nèi)合成的分枝菌酸前體轉(zhuǎn)運到細(xì)胞膜外，扮演著“傳送機”的角色，而這臺傳送機的動力來源于從膜外向膜內(nèi)流動的質(zhì)子流。
由上海科技大學(xué)免疫化學(xué)研究所特聘教授饒子和院士率領(lǐng)的科研團隊首次成功解析了這一關(guān)鍵蛋白MmpL3以及“藥靶─藥物”復(fù)合物的三維空間結(jié)構(gòu)，揭示了創(chuàng)新藥物殺死細(xì)菌的全新分子機制。他們還解析了利莫那班與MmpL3蛋白復(fù)合物的三維結(jié)構(gòu)，從而證實了利莫那班會神奇地堵住MmpL3的質(zhì)子內(nèi)流通道，這種“封堵”與已知的結(jié)合模式大相徑庭。
全世界目前有約1/4的人口被結(jié)核桿菌感染，由于艾滋病與結(jié)核病的交叉感染以及藥物的不合理使用，已經(jīng)產(chǎn)生了嚴(yán)重的耐藥結(jié)核病，針對結(jié)核桿菌的新藥靶點的發(fā)現(xiàn)以及新藥研發(fā)迫在眉睫。新機制的發(fā)現(xiàn)為新型抗生素的研發(fā)、解決全球日趨嚴(yán)重的抗生素耐藥問題開辟了一條全新途徑。
研究發(fā)現(xiàn)，抑制劑小分子都靶向MmpL3蛋白的跨膜區(qū)，直接“封閉”該蛋白的質(zhì)子內(nèi)流通道，破壞MmpL3工作時的能量供給，造成這臺傳送機“癱瘓”。為了設(shè)計更有效的抑制劑，研究團隊還利用計算機“虛擬篩選”技術(shù)，對成藥庫的藥物分子進行了篩選。這才發(fā)現(xiàn)減肥藥也是結(jié)核桿菌的“毒藥”。
